兒童髓母細(xì)胞瘤的陣列CGH分析(Array CGH Analysis of Pediatric Medulloblastomas) 英文摘要: Brain tumors are the second most common childhood cancer. We used high-resolution array comparative genomic hybridization(aCGH) to...
兒童髓母細(xì)胞瘤的陣列CGH分析(Array CGH Analysis of Pediatric Medulloblastomas)
英文摘要:
Brain tumors are the second most common childhood cancer. We used high-resolution array comparative genomic hybridization(aCGH) to analyze losses and gains of genetic material from 24 medulloblastomas. The bacterial artificial chromosome clones were ordered on the array, allowing for an average resolution of approximately 420 kilobases. The advantage of this high resolution is that the breakpoints associated with subregional chromosome copy number aberrations can be accurately defined, which in turn allows candidate genes within these regions to be readily defined. In this analysis, we confirmed the frequent involvement of loss of 17p and gain of 17q, although we have now established the position of the breakpoint that consistently lies in the chr17:18318880-19046234 region of the chromosome. Other frequent losses were seen on 8p, 10q, 16q, and 20p, and frequent gains were seen on 2p, 4p, 7, and 19. In addition, the fine-resolution mapping provided by aCGH made it possible to define small chromosome deletions in 1q23.3-q24.2, 2q13.12-q13.2, 6q25-qter, 8p23.1, 10q25.1, and 12q13.12-q13.2. Overall, amplification events were rare, the most common involving MYC (16%), on 8q, although isolated events were seen in 10p11 and 3q.
中文摘要:
腦瘤是二常見的兒童癌癥。我們使用高分辨率陣列比較基因組雜交技術(shù)(aCGH)分析了24個(gè)髓母細(xì)胞瘤的遺傳物質(zhì)的得失。細(xì)菌人工染色體克隆排列在陣列上,平均分辨率約為420千堿基。這種高分辨率的優(yōu)點(diǎn)是,與次區(qū)域染色體拷貝數(shù)畸變相關(guān)的斷點(diǎn)可以被精確定義,這反過來又使這些區(qū)域內(nèi)的候選基因容易定義。在這次分析中,我們確認(rèn)了17p的丟失和17q的獲得的頻繁參與,雖然我們現(xiàn)在已經(jīng)確定了斷點(diǎn)的位置,始終位于染色體的chr17:18318880-19046234區(qū)域。8p、10q、16q、20p出現(xiàn)其他頻繁虧損,2p、4p、7、19出現(xiàn)頻繁盈利。此外,aCGH所提供的細(xì)致定位使得在1q23.3-q24.2、2q13.12-q13.2、6q25-qter、8p23.1、10q25.1、12q13.12-q13.2中定義小的染色體缺失成為可能。總的來說,擴(kuò)增事件是少見的,在8q上較常見的涉及MYC(16%),盡管在10p11和3q中出現(xiàn)了孤立事件。
腦瘤是較常見的兒童實(shí)體瘤,年發(fā)病率約為百萬分之五,總發(fā)病率僅次于白血病(Packer, 1990)。髓母細(xì)胞瘤是兒科較常見的
腦腫瘤,是一種起源于小腦的侵襲性腫瘤。盡管有證據(jù)表明
髓母細(xì)胞瘤是外周神經(jīng)外胚層腫瘤(PNETs)的一部分,但基因表達(dá)譜顯示它們可能是一種獨(dú)特的瘤種(Pomeroy et al., 2002)。5年的總存活率在50%-60%之間,盡管由于局部復(fù)發(fā)或轉(zhuǎn)移,長(zhǎng)期存活率下降到30%。傳統(tǒng)上,預(yù)后是基于年齡、可能切除的范圍和轉(zhuǎn)移性疾病,盡管這些參數(shù)并不總是評(píng)估預(yù)后或指示具體的治療?;诮M織病理學(xué)的生存或預(yù)后的相關(guān)性已被提出,盡管它通常與分子標(biāo)記聯(lián)合支持(Eberhart et al.,2004;Lamont等,2004;Ozer等,2004;Ray等人,2004)。由于這個(gè)原因,已經(jīng)有相當(dāng)多的努力來識(shí)別輔助遺傳標(biāo)記作為預(yù)后指標(biāo)(Biegel 1999)。
在癌癥發(fā)展的多階段理論(Fearon and Vogelstein, 1990)中,提出癌癥的發(fā)展是通過積累基因變化,為進(jìn)化中的腫瘤提供選擇性優(yōu)勢(shì)。重建這些事件假設(shè)早期事件發(fā)生在一個(gè)相對(duì)穩(wěn)定的遺傳背景下,高度不穩(wěn)定的基因組反映了更高級(jí)的階段。如果這對(duì)髓母細(xì)胞瘤是真的,那么從我們的研究來看,至少有兩個(gè)事件可能被認(rèn)為是“早期”的。“一些腫瘤顯示出17p的損失/17q的增加,作為的異常,這是一個(gè)早期的事件。6號(hào)染色體長(zhǎng)臂的缺失也可以考慮。顯然,本研究中分析的腫瘤數(shù)量太少,無法得出確切的結(jié)論,但使用aCGH定義的損失和收益的高分辨率定義為理解基因組中可能參與這些腫瘤發(fā)展的關(guān)鍵區(qū)域奠定了基礎(chǔ)。
INC國(guó)際神經(jīng)外科醫(yī)生集團(tuán)旗下國(guó)際神經(jīng)外科顧問團(tuán)(WANG)成員
James T. Rutka教授作為該研究的主要成員之一,在較近的臨床研究上,教授又將重點(diǎn)集中在了兒童腦瘤的研究上,并取得了合適的成果。其實(shí)驗(yàn)室在研究腦腫瘤生長(zhǎng)和侵襲的機(jī)制方面頗有成就,并在Sunnybrook健康科學(xué)中心和多倫多大學(xué)生物材料和生物醫(yī)學(xué)工程研究所的合作下,正在設(shè)計(jì)一種基于納米顆粒的輸送系統(tǒng),作為治療腦瘤的一種新方法。
- 文章標(biāo)題:兒童髓母細(xì)胞瘤的陣列CGH分析
- 更新時(shí)間:2019-10-14 17:27:13
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